Connaissez-vous BIOPTIMUS, la startup française qui veut programmer la biologie avec l’IA ?

La biologie représente un défi majeur en raison de sa complexité. Malgré les progrès scientifiques, près de 90 % des médicaments échouent lors des essais cliniques. L'intelligence artificielle (IA) a récemment permis des avancées, comme la prédiction de la structure des protéines par AlphaFold. Cependant, une compréhension complète du vivant nécessite une approche intégrant gènes, protéines, cellules et autres facteurs.

Bioptimus, une startup parisienne, vise à créer un modèle multi-échelle et multi-modal pour la biologie, surnommé le « GPT du vivant », capable de générer des simulations biologiques.

En un an, Bioptimus a lancé H-Optimus-0, le plus grand modèle d'IA open source pour la pathologie. Validé par des équipes de Harvard et de l'université de Leeds, ce modèle excelle dans la prédiction de l'expression génique, le subtypage de cancers et la détection de biomarqueurs. Avec déjà plus de 100 000 téléchargements, Bioptimus prévoit de développer un modèle multimodal liant données génétiques et imagerie.

À long terme, Bioptimus ambitionne de créer des jumeaux numériques de patients pour simuler l'effet des traitements et personnaliser les stratégies thérapeutiques.

Pour modéliser la biologie, Bioptimus a sécurisé des données, des capacités de calcul et une équipe de spécialistes. La startup combine des données publiques avec des partenariats pour alimenter ses modèles. Financée à hauteur de 65 millions d'euros, Bioptimus investit dans des infrastructures cloud et des clusters GPU. L'équipe regroupe des experts de Google DeepMind, Owkin et du milieu académique.

Bioptimus doit gérer les contraintes éthiques et la diversité des données. Les modèles peuvent être biaisés par des artefacts technologiques ou des pratiques spécifiques. La diversité recherchée inclut la technologie des scanners et les pratiques hospitalières. Un comité consultatif scientifique guide les choix stratégiques et assure la conformité des modèles.

Bioptimus évolue dans un secteur concurrentiel face à des acteurs comme Isomorphic Labs et XtalPi. En janvier 2025, la startup a levé 41 millions d'euros en Series A, portant ses financements totaux à environ 76 millions de dollars. Bioptimus se concentre sur des choix disciplinés pour cibler les pathologies et développer des modèles différenciants.

Jean-Philippe Vert, co-fondateur et CEO, possède une solide expérience en IA pour les sciences du vivant, accompagné de co-fondateurs issus de Google DeepMind et Owkin. L'équipe inclut des experts en machine learning, bioinformatique et modélisation biomédicale, avec un leadership opérationnel assuré par Mathilda Ström, COO depuis novembre 2024.

D’après FrenchWeb.